Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Tssk4-203ENSMUST00000226497 1235 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trappc2Q9CQP2 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms