Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shq1Q7TMX5 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms