Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms