Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Psenen-202ENSMUST00000207031 316 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 AC156164.1-201ENSMUST00000216958 225 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 CT010475.1-201ENSMUST00000224753 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1184-201ENSMUST00000050038 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gbp8-202ENSMUST00000112718 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Lilr4b-201ENSMUST00000102894 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zfp42-203ENSMUST00000211248 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Swt1-201ENSMUST00000064771 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Glipr1l2-201ENSMUST00000020434 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Glb1l2-202ENSMUST00000066560 3688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Adam17-202ENSMUST00000101551 4469 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 4933427I04Rik-201ENSMUST00000097896 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rhox4f-201ENSMUST00000115170 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Cenpq-201ENSMUST00000087114 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Wdr77-201ENSMUST00000010278 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mcf2l-201ENSMUST00000095456 3926 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Trim13-201ENSMUST00000039562 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Napb-201ENSMUST00000028926 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zwint-201ENSMUST00000020081 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms