Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ighv1-57-201ENSMUST00000194898 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gsta1-201ENSMUST00000098537 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Eif3l-201ENSMUST00000040518 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Vps8-201ENSMUST00000096191 4952 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Ccdc80-201ENSMUST00000061050 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 2900052N01Rik-203ENSMUST00000191603 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Utp6-202ENSMUST00000108241 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Msl3-202ENSMUST00000112137 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm13535-201ENSMUST00000118714 1884 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Polr1e-201ENSMUST00000029999 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Camk2a-202ENSMUST00000039904 1734 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm3126-201ENSMUST00000216513 1468 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms