Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Puf60Q3UEB3 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Puf60Q3UEB3 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms