Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms