Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms