Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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