Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm12002-202ENSMUST00000153794 1803 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm28989-201ENSMUST00000187867 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Slco2b1-201ENSMUST00000032985 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 AC136986.2-201ENSMUST00000220880 2944 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms