Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ssxb8B1AY40 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ssxb8B1AY40 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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