Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rb1cc1Q9ESK9 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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