Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Commd4Q9CQ02 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms