Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms