Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms