Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc18Q640L5 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms