Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PcolceQ61398 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms