Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r56-201ENSMUST00000163852 2340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Psg19-203ENSMUST00000182853 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gucd1-202ENSMUST00000118936 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ap5s1-204ENSMUST00000110210 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Tma7-ps-201ENSMUST00000118448 195 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm12046-201ENSMUST00000118536 331 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm24991-201ENSMUST00000157405 108 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm25551-201ENSMUST00000158082 103 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mir2139-201ENSMUST00000158669 95 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm28477-201ENSMUST00000188125 406 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 CT485606.2-201ENSMUST00000216728 401 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 AC153974.1-201ENSMUST00000219012 430 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm29108-201ENSMUST00000186020 1498 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Nox1-202ENSMUST00000113275 1694 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Commd2-202ENSMUST00000160959 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Adh6b-202ENSMUST00000199673 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Timp1-202ENSMUST00000115342 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm5979-201ENSMUST00000193850 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm43145-201ENSMUST00000198963 628 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms