Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm4305-201ENSMUST00000219159 910 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm36208-201ENSMUST00000220013 429 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Dnm3-205ENSMUST00000160665 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Myzap-204ENSMUST00000169573 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ispd-203ENSMUST00000221177 1456 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rtp3-203ENSMUST00000199891 2463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ccdc159-201ENSMUST00000006403 1531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Mgl2-201ENSMUST00000041550 1586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pdcl-201ENSMUST00000009174 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pfkfb2-213ENSMUST00000191347 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm18876-201ENSMUST00000219985 1849 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cops2-201ENSMUST00000028635 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ywhae-201ENSMUST00000067664 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Zcchc18-203ENSMUST00000113067 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Acox3-202ENSMUST00000068947 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Pilra-201ENSMUST00000058897 2578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 4930444E06Rik-201ENSMUST00000146746 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rps10-208ENSMUST00000178774 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm9637-201ENSMUST00000179141 873 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm16416-201ENSMUST00000179660 483 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm27913-201ENSMUST00000184473 173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rpl21-ps1-201ENSMUST00000193804 480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms