Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Q3U6N9 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Q3U6N9 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms