Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Dgat2l6-201ENSMUST00000037541 1640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Taok3-201ENSMUST00000092889 4354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ccdc28a-201ENSMUST00000052648 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Srpx2-202ENSMUST00000113304 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Dgka-201ENSMUST00000026414 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pax6-205ENSMUST00000111085 2779 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mbl2-201ENSMUST00000025797 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Runx1-207ENSMUST00000189679 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Nron-203ENSMUST00000156297 3340 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zscan29-202ENSMUST00000110661 5072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tmem175-203ENSMUST00000120327 1811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Fgr-204ENSMUST00000171223 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Jade1-206ENSMUST00000191952 3327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Phactr4-201ENSMUST00000084170 4483 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Thsd1-203ENSMUST00000162447 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ncor1-202ENSMUST00000037575 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Selenop-203ENSMUST00000159216 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cyp2j9-201ENSMUST00000055693 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cyp2d37-ps-201ENSMUST00000100380 590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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