Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pus3-201ENSMUST00000034615 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Tyrp1-202ENSMUST00000102831 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Eri2-207ENSMUST00000150844 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm2136-201ENSMUST00000193945 2577 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 Iqcc-202ENSMUST00000121442 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 Gm12493-201ENSMUST00000150111 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Serpinb6a-202ENSMUST00000043552 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Agtr1b-201ENSMUST00000068316 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Nadk-202ENSMUST00000105612 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Vsig1-201ENSMUST00000033806 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Gm28038F7BCN9 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Acad11-207ENSMUST00000189998 2030 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ppp2r2b-201ENSMUST00000025377 2031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Mad2l1-201ENSMUST00000101343 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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