Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm22484-201ENSMUST00000157992 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Defa35E9QLQ1 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms