Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms