Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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OtofQ9ESF1 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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OtofQ9ESF1 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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