Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dbndd2-203ENSMUST00000109349 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rnf19a-201ENSMUST00000022890 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Zfp169-207ENSMUST00000177530 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Vps11-201ENSMUST00000034644 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Clstn3-201ENSMUST00000008297 4014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms