Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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