Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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AtmQ62388 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AtmQ62388 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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