Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp87-203ENSMUST00000181573 382 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35a4-205ENSMUST00000185899 312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv12-42-201ENSMUST00000198769 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC124687.4-201ENSMUST00000222361 463 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC138667.1-201ENSMUST00000225472 316 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ctss-202ENSMUST00000116304 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12996-201ENSMUST00000151670 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11431-201ENSMUST00000155046 428 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9120-201ENSMUST00000190835 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6204-201ENSMUST00000198872 457 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9662-201ENSMUST00000216748 1206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1382-201ENSMUST00000074543 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Prim1-205ENSMUST00000178041 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33940-201ENSMUST00000209205 1601 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms