Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms