Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 4430402I18Rik-208ENSMUST00000179171 2638 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 1700113B19Rik-201ENSMUST00000191817 420 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 H2-M1-201ENSMUST00000041662 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Samd3-201ENSMUST00000060716 1874 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp9yF8VPU6 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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