Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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