Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm10101-202ENSMUST00000181311 2919 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 BC026762-201ENSMUST00000206555 2503 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 4931431C16Rik-201ENSMUST00000124643 2735 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Tifab-201ENSMUST00000169652 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm2136-201ENSMUST00000193945 2577 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Def8-205ENSMUST00000108832 3242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Def8-201ENSMUST00000001522 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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