Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm10069-201ENSMUST00000144745 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Tagap-201ENSMUST00000036370 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc18Q640L5 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms