Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm4823-201ENSMUST00000181990 984 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm39094-202ENSMUST00000206679 624 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm46197-201ENSMUST00000217530 416 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Uspl1-204ENSMUST00000119685 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr297-202ENSMUST00000172965 1928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tspan7-201ENSMUST00000076354 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhb12-201ENSMUST00000055495 3034 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rbm5-214ENSMUST00000182659 3205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tprkb-205ENSMUST00000113753 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm28382-201ENSMUST00000187902 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Foxp3-201ENSMUST00000045566 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ints10-204ENSMUST00000110242 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Pus10-202ENSMUST00000058163 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Itih5l-ps-202ENSMUST00000148862 808 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Gm44180-201ENSMUST00000203671 408 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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