Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Lpar1-202ENSMUST00000107570 3244 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 L3mbtl2-204ENSMUST00000172748 3368 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm6063-201ENSMUST00000206958 485 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm37699-201ENSMUST00000194753 3338 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 4930543N07Rik-201ENSMUST00000209357 1364 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms