Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms