Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TtrP07309 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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TtrP07309 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TtrP07309 AC124465.1-201ENSMUST00000222349 746 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TtrP07309 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TtrP07309 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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