Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm12312-201ENSMUST00000120351 644 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm22198-201ENSMUST00000122659 307 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm6410-201ENSMUST00000181337 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Olfr1331-201ENSMUST00000094831 954 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Kbtbd4-202ENSMUST00000111464 2343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 A930002I21Rik-201ENSMUST00000060946 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Serinc4-201ENSMUST00000056312 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Casc1-201ENSMUST00000060797 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 March7-201ENSMUST00000067542 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm28989-201ENSMUST00000187867 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Fshb-201ENSMUST00000028533 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Lrguk-201ENSMUST00000070189 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm2035J3QP87 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms