Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Hibch-202ENSMUST00000159352 1704 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
OtofQ9ESF1 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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