Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rnf17Q99MV7 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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