Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm37787-201ENSMUST00000192524 585 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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