Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm11690-201ENSMUST00000128183 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Tdrd5-204ENSMUST00000167528 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Nbr1-204ENSMUST00000107208 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Fer-201ENSMUST00000000129 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Casc1-201ENSMUST00000060797 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr641-202ENSMUST00000213214 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Kin-201ENSMUST00000042512 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Slc29a3-202ENSMUST00000119595 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC102431.2-201ENSMUST00000224071 2448 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Sp100-202ENSMUST00000066427 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Timeless-203ENSMUST00000105242 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Txnrd1-205ENSMUST00000219368 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Rab23-202ENSMUST00000115174 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Erc2-210ENSMUST00000211145 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43836-201ENSMUST00000196532 381 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm42634-201ENSMUST00000197362 381 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms