Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g2c-202ENSMUST00000105808 3448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr980-201ENSMUST00000073932 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Brinp3-205ENSMUST00000166814 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Pvr-201ENSMUST00000043517 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rnasel-201ENSMUST00000086209 2938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sf3b2Q3UJB0 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms