Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
RxraP28700 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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