Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
P20040 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P20040 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
P20040 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
P20040 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
P20040 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
P20040 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P20040 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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