Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC125223.1-201ENSMUST00000224004 749 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmco5-201ENSMUST00000028834 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zfp57-212ENSMUST00000174672 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 L3mbtl3-203ENSMUST00000174766 3411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm23377-202ENSMUST00000196828 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6578-202ENSMUST00000203684 560 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm44790-201ENSMUST00000204137 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dcpp1-201ENSMUST00000068580 617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mir130b-201ENSMUST00000083638 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms