Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Zbed5B2RPU8 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms