Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrit3W8DXL4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrit3W8DXL4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms