Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a4Q9Z306 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a4Q9Z306 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms